1指示代名詞的に使われる「それ」が主語や話題を示す表現(文脈によって『それが』で主語を導入する)。
それが問題の本質だと思う。
彼の言ったこと、それが真実かどうか確認したい。
2会話で相手の質問に対してためらいや前置きを示す表現で、「えーと」「あの、実は」と同様に使われる(話し始めの言葉)。
「来週の件なんだけど」「それが…ちょっと都合が悪くて。」
それが、まだ決めかねているんです。