1化学で、複数の原子が結合してできる最小の単位。物質の性質を決める構成要素。
水は酸素原子と水素原子が結合した分子だ。
この反応では大きな有機分子が生成される。
分子の構造を調べるためにスペクトル解析を行った。
2数学（分数）で、分母の上に書かれる数。全体をいくつに分けたうちのいくつかを示す。
分数3/4では、3が分子で4が分母だ。
通分するときは、分子と分母に同じ数を掛ける。
3集団や組織の一員、あるいはある性質を持つ要素を指す語。例：過激分子（過激な考えを持つ人）。
警察は過激な分子の取り締まりを強化した。
その政党には改革を求める分子が少なくない。
4小さな粒子・微粒子を指す語（「微分子」などに関係する用法）。
空気中に浮遊する微小な分子が計測装置で検出された。
このフィルターは分子レベルの微粒子まで除去する。